10 марта 1999 года он проводил мастер-класс в Центральном доме кинематографистов, когда двое вошедших "лимоновцев" начали закидывать его куриными яйцами. Имеются фотографии того, что Никита Сергеевич ударил ногой в лицо одного из молодых людей, которых уже крепко держали за руки. Сам Н.Михалков факт удара отрицает.
Президент Союза кинематографистов Никита Михалков принял решение о реконструкции (что фактически означало снос) Дома кино Москвы (адрес — Васильевская, 13). На обсуждении выяснилось, что судьба 6 млн долларов, полученных от продажи Киноцентра, неизвестна.
Никита Михалков был одним из нескольких авторов "письма Путину" с просьбой от имени "всех представителей творческих профессий в России" остаться на третий срок. После чего ряд "представителей творческих профессий" (например, актеры Олег Басилашвили и Сергей Юрский, художник Юрий Аввакумов и драматург Александр Гельман) подвергли резкой критике Михалкова и его коллег.
Будучи главой нескольких союзов и советов по культуре, Никита Михалков подозревается в пренебрежении другими деятелями культуры, в частности, несмотря на имеющийся устав Союза кинематографистов, был избран его председателем при менее, чем 2/3 отданных за него голосов.
